پس از ارجاع بیمار توسط پزشک معالج و تکمیل پرونده بیمار و اخذ پیش‌پرداخت، هماهنگی مورد نیاز جهت انجام تصویربرداری سی تی اسکن و یا در صورت نیاز دیگر انواع تصویربرداری پزشکی صورت میپذیرد. پس از انجام بررسی اولیه و تایید تصاویر دریافتی، مدل سه بعدی اندام بیمار استخراج شده و طرح درمان اولیه بر اساس درخواست پزشک در مرحله ارجاع پیاده سازی میگردد. طراحی انجام گرفته برای پزشک معالج جهت گرفتن تاییدیه ارسال میگردد. در این مرحله در صورت نیاز و طبق درخواست پزشک معالج اصلاحاتی انجام خواهد گرفت و در غیر این صورت، طراحی انجام گرفته برای انجام فرایند ساخت ارسال خواهد شد. 

در طی فرایند ساخت، پروتز سفارشی توسط پرینتر سه بعدی پرینت خواهد شد و پس از انجام عملیات حرارتی بر اساس پروتکل مورد نیاز بسته به مورد استفاده پروتز، قطعه برای انجام عملیات تکمیلی ارسال خواهد شد. عملیات تکمیلی اعم از انجام ماشینکاری ثانویه، انجام پوشش دهی، آنودایز کردن، و یا پولیش کردن قطعه در این مرحله صورت میگیرد و نهایتا قطعه برای انجام عملیات شستشو و بسته بندی به اتاق تمیز ارسال میشود. در آخرین مرحله قطعه بسته بندی شده توسط اشعه گاما استریل میشود و به همراه کارشناس به اتاق عمل ارسال میگردد.

طراحی و ساخت پروتزهای سفارشی، همانگونه که از اسم آن نیز مشخص است، شامل دو بخش میباشد. در مرحله طراحی، زمان مورد نیاز تابع سرعت عمل بیمار در انجام تصویربرداری‌های مورد نیاز، و همچنین زمان مورد نیاز پزشک معالج جهت تایید و یا اصلاح طراحی انجام شده میباشد. علاوه بر این، در مواردی که طراحی دستخوش تغییرات می‌گردد بدیهی است که زمان بیشتری نیاز خواهد بود. 
در مرحله ساخت، بسته به ابعاد قطعه و فوریت پروتز مورد استفاده میتواند زمان متفاوت باشد. همچنین تعداد و نوع عملیات تکمیلی نیز در زمان مورد نیاز جهت ساخت و آماده سازی پروتز طراحی شده تاثیرگذار خواهد بود. 

به صورت میانگین فرایند طراحی و ساخت پروتزهای سفارشی مدت زمان 10 هفته از زمان ارجاع توسط پزشک می‌تواند زمانبر باشد. لیکن در عمده موارد زمان تحویل پروتز به بیماران کوتاه‌تر بوده است.

در حال حاضر بیمه‌های پایه پوششی جهت پروتزهای سفارشی ارائه نمی‌کنند. در مورد بیمه‌های تکمیلی بستگی به شرکت بیمه‌گر دارد و در بسیاری موارد شرکت بیمه به استناد درخواست پزشک و به همراه فاکتور رسمی شرکت بخشی از هزینه پروتز سفارشی را مطابق قرارداد بین بیمه‌گر و بیمه‌گذار پرداخت نموده است.

پروتزهای سفارشی ساخته شده به روش پرینت سه بعدی، مشابه پروتزهای تولید شده به روش‌های متداول تولید انبوه بوده و صرفا تفاوت آن در تولید تکی محصولات میباشد که بر اساس آناتومی بیماران طراحی و ساخته میشود. لذا از نظر بحث خطرات و عوارض، این نوع پروتزها کاملا مشابه پروتزها و پلاک‌های متداول می‌باشند.